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[VMD]

VMD安装求助

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Marc0

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楼主

发表于 Post on 2021-9-28 14:39:24

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我通过VMD官网,将1.9.4版本(Windows 64-bit, CUDA, OptiX, OSPRay (64-bit Intel x86_64) (Windows 10))软件下载到自己的win10系统笔记本电脑中。

安装过程顺利,没有提示报错。

双击运行程序,发现无法读取xyz文件。(文件来自sob老师的帖子 http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html,应该不是文件的问题)

随后发现VMD界面显示以下内容:

Info) VMD for WIN64, version 1.9.4a53 (June 29, 2021)

Info) http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/

Info) Email questions and bug reports to vmd@ks.uiuc.edu

Info) Please include this reference in published work using VMD:

Info) Humphrey, W., Dalke, A. and Schulten, K., `VMD - Visual

Info) Molecular Dynamics', J. Molec. Graphics 1996, 14.1, 33-38.

Info) -------------------------------------------------------------

Info) Multithreading available, 8 CPUs, ISA dispatch enabled.

Info) CPU features: SSE2 SSE4.1 AVX AVX2 FMA F16 HT

Info) Free system memory: 1384MB (17%)

Info) Creating CUDA device pool and initializing hardware...

Info) Unable to load NVML library, GPU-CPU affinity unavailable.

Info) Detected 1 available CUDA accelerator::

Info) [0] GeForce MX250 3 SM_6.1 1.6 GHz, 2.0GB RAM SP32 KT AE5 ZC

Info) OpenGL renderer: GeForce MX250/PCIe/SSE2

Info) Features: STENCIL MDE CVA MTX NPOT PP PS GLSL(OVFGS)

Info) Full GLSL rendering mode is available.

Info) Textures: 2-D (32768x32768), 3-D (16384x16384x16384), Multitexture (4)

Info) No joysticks found. Joystick interface disabled.

Info) Detected 1 available TachyonL/OptiX ray tracing accelerator

Info) Compiling OptiX shaders on 1 target GPU...

Info) Dynamically loaded 76 plugins in directory:

Info) C:/Program Files/VMD/plugins/WIN64/molfile

vmd >

其中出现了 unable, no found 等否定词。这是不是意味着VMD未能正确安装?如果是,该如何解决?

以上。十分感谢~!

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exity

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发表于 Post on 2021-9-28 14:45:39

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没事不要用1.9.4

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牧生

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发表于 Post on 2021-9-28 14:49:44

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详情参见此贴

http://bbs.keinsci.com/thread-25275-1-1.html

又菜又爱玩

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Marc0

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发表于 Post on 2021-9-28 14:53:40

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牧生 发表于 2021-9-28 14:49

详情参见此贴

http://bbs.keinsci.com/thread-25275-1-1.html

晓得了,我还是去装1.9.3吧

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Marc0

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发表于 Post on 2021-9-28 14:54:15

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exity 发表于 2021-9-28 14:45

没事不要用1.9.4

刚想问为啥,看了@牧生 的帖子晓得了

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sobereva

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发表于 Post on 2021-9-28 18:26:27

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注意当前版本号1.9.4a53,不是一个干干净净的1.9.4就绝对不要用,也绝对不要说成1.9.4

北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。

欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!

欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。

思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)

Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)

Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ

ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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Marc0

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楼主 Author|

发表于 Post on 2021-9-29 17:04:36

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sobereva 发表于 2021-9-28 18:26

注意当前版本号1.9.4a53,不是一个干干净净的1.9.4就绝对不要用,也绝对不要说成1.9.4

已卸载并安装1.9.3

可正常使用了

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CO2RRlearner

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发表于 Post on 2022-12-27 17:12:26

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本帖最后由 CO2RRlearner 于 2022-12-27 17:15 编辑

(base) [andyzhangwei@mu02 src]$ vmd

/public/home/andyzhangwei/apps/vmd-1.9.3/vmd-1.9.3/vmd/vmd_LINUXAMD64: /lib64/libGL.so.1: no version information available (required by /public/home/andyzhangwei/apps/vmd-1.9.3/vmd-1.9.3/vmd/vmd_LINUXAMD64)

Info) VMD for LINUXAMD64, version 1.9.3 (November 30, 2016)

Info) http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/

Info) Email questions and bug reports to vmd@ks.uiuc.edu

Info) Please include this reference in published work using VMD:

Info) Humphrey, W., Dalke, A. and Schulten, K., `VMD - Visual

Info) Molecular Dynamics', J. Molec. Graphics 1996, 14.1, 33-38.

Info) -------------------------------------------------------------

Info) Multithreading available, 16 CPUs detected.

Info) CPU features: SSE2 AVX AVX2 FMA

Info) Free system memory: 32GB (51%)

Info) No CUDA accelerator devices available.

Info) Dynamically loaded 2 plugins in directory:

Info) /public/home/andyzhangwei/apps/vmd-1.9.3/vmd-1.9.3/vmd/plugins/LINUXAMD64/molfile

vmd >

安装的1.9.3版本,但是vmd还是这个,请问是哪里的问题呀

LINUX_64 OpenGL, CUDA, OptiX, OSPRay (Linux (RHEL 6.7 and later) 64-bit Intel/AMD x86_64 SSE, with CUDA 8.x, OptiX, OSPRay)

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